学部・大学院区分情報・博前
時間割コード2520066
科目区分
主専攻科目
科目名 【日本語】バイオインフォマティクス特論1
科目名 【英語】
コースナンバリングコードGSI126066J
担当教員 【日本語】太田 元規 ○
担当教員 【英語】OTA Motonori ○
単位数1
開講期・開講時間帯春2期 木曜日 3時限
Spring2 Thu 3
対象学年1年
1
授業形態
開講系(学部)・開講専攻(大学院)
複雑系科学専攻
必修・選択


授業の目的 【日本語】
授業の目的 【英語】
Students will learn the basic knowledge of Bioinformatics
到達目標 【日本語】
生命現象を理論的に扱う研究分野:バイオインフォマティクスについて,基礎的なことがらの習得を目的とする。
到達目標 【英語】
Students will learn the basic knowledge of Bioinformatics
授業の内容や構成
ゲノム,DNA配列,タンパク質の配列や立体構造,相互作用などに関する生命情報データベースを概観し,配列比較法,構造予測法,遺伝子発現データの利用法などについて学習する。
講義は座学を中心とするが,方法論やアルゴリズムを体感するために,簡単な演習も行う場合がある。
1回の講義はコンピューター実習としてインターネットでアクセスできるデータベースや予測・解析サーバの使い方を学習する。

〔計画〕
1. ゲノム,DNA,タンパク質
2. 配列と立体構造
3. 生命情報データベース
4. ホモロジーサーチ
5. タンパク質の立体構造予測
6. コンピューター実習
Survey databases of genome, DNA sequence, protein sequence, structure and interactions, and lean the sequence and structure comparison, and analyze the gene expression data
履修条件・関連する科目
成績評価の方法と基準
授業の中で演習を実施し,真剣に取り組む態度を評価する。
授業中に積極的に質問などをし,理解を深める態度を評価する。
合計100点満点で60点以上を合格とする。
Evaluate the ones who show good remark in the practice. Give unit if they mark more than 60 points.
教科書・参考書
タンパク質の立体構造入門(講談社)
履修条件は要さない。
Shown in the lecture
課外学習等(授業時間外学習の指示)
自分にあったバイオインフォマティクスの教科書を選び,通読することが望ましい。
I demand each student will seek text book of bioinformatcs that would be readable
授業開講形態等
遠隔授業(オンデマンド型)で行う場合の追加措置