学部・大学院区分
Undergraduate / Graduate		医・博前
時間割コード
Registration Code		3821007
科目名　【日本語】
Course Title		社会健康情報学特論
科目名　【英語】
Course Title		Advanced Topics on Real-world Health Informatics
コースナンバリングコード
Course Numbering Code
担当教員　【日本語】
Instructor		中杤　昌弘 ○ 近藤　高明 松井　佑介
担当教員　【英語】
Instructor		NAKATOCHI Masahiro ○ KONDO Takaaki MATSUI Yusuke
単位数
Credits		2
開講期・開講時間帯
Term / Day / Period		春集中 その他 その他
Intensive(Spring) Other Other
必修・選択
Required / Selected


授業の目的　【日本語】
Goals of the Course(JPN)
社会・集団レベルでのヒトの健康理解と予防医療の開発に必要な大規模リアルワールドデータに基づく科学的エビデンスの構築方法についての習得を目指し、ゲノムをはじめとした分子レベルから個体レベル、果ては社会レベルにいたるまでのあらゆる健康医療に関わるデータに対して、疫学、公衆衛生、遺伝学、医学・生物統計学およびインフォマティクスを融合させたアプローチの実践的概念とスキルを習得するとともに、それらの医療および社会実装へ向けたアプローチについて実践的に学ぶ。
授業の目的　【英語】
Goals of the Course
Aiming to learn how to construct scientific evidence based on large-scale real-world data necessary for understanding human health and developing preventive medicine at the social and collective levels. Learn practical concepts and skills of an approach that combines epidemiology, public health, genetics, medical and biostatistics, and informatics for all health and medical data, down to the social level. Learn practically the approaches to their medical and social implementation.
到達目標　【日本語】
Objectives of the Course(JPN)
社会・集団を対象に大規模なヒトの健康情報が収集されるようになってきた。本講義では、健康情報のうち、大規模な疫学・遺伝学的アプローチによって得られたリアルワールドデータの取り扱い・解析方法を身に着ける。主に、Linux上でR及びPLINKを活用し、データを取得してから前処理・統計解析・結果の考察までを自ら行うスキル・知識を習得させることを目標とする。
到達目標　【英語】
Objectives of the Course
授業の内容や構成
Course Content / Plan
大規模なヒト集団から得られたコホートデータやゲノムデータ(主に一塩基多型(SNP))を中心に扱う。主に、R及びbashを活用し、データを取得してから前処理・統計解析・結果の考察までを実践的ハンズオン形式で進める。
履修条件・関連する科目
Course Prerequisites and Related Courses
本講義「社会健康情報学特論」と、「社会健康情報学実習」はセットであり、互いに関連している。両方受講することが好ましい。
「保健医療データ活用法入門」とも関連する。
学部在籍中に統計学・疫学の講義を受講していることが望ましい
成績評価の方法と基準
Course Evaluation Method and Criteria
課題レポート、講義への参加状況
教科書・テキスト
Textbook
特に無し
参考書
Reference Book
特に無し
課外学習等（授業時間外学習の指示）
Study Load(Self-directed Learning Outside Course Hours)
特に無し
授業の進め方
How to proceed with the class
本講義は、集中講義形式で行う。演習も実施する。各自PCを用意すること。
開催日は、8月28日と9月4日。二日間の講義となる。
注意事項
Notice for Students
PCを準備し、事前にRをインストールしておいてください（Windowsの方:
https://cran.ism.ac.jp/bin/windows/base/ MacOSの方:　https://cran.ism.ac.jp/bin/macosx/）。
PLINKをインストールしておいてください(https://www.cog-genomics.org/plink2/)。

Linuxを使用します。Windowsの方はWindows Subsystem for Linuxをインストールしてもらいます。
インストールの仕方や注意事項は事前に通知します。
本授業に関する参照Webページ
Reference website for this Course
担当教員からのメッセージ
Message from the Instructor
使用言語
Language(s) for Instruction & Discussion
日英併用
授業開講形態等
Lecture format, etc.
遠隔授業（オンデマンド型）で行う場合の追加措置
Additional measures for remote class (on-demand class)
オンラインと対面講義のハイブリッドで行う。どちらで参加しても良い。