学部・大学院区分
Undergraduate / Graduate

理・博前

時間割コード
Registration Code

2630359

科目区分
Course Category

Ｃ類
Category C

科目名　【日本語】
Course Title

生体分子動態機能講究３

科目名　【英語】
Course Title

Colloquium Biomolecular Dynamics and Function 3

コースナンバリングコード
Course Numbering Code

担当教員　【日本語】
Instructor

内橋　貴之 ○

担当教員　【英語】
Instructor

UCHIHASHI Takayuki ○

単位数
Credits

開講期・開講時間帯
Term / Day / Period

春集中その他その他
Intensive(Spring) Other Other

授業形態
Course style

学科・専攻
Department / Program

理学研究科・物質理学専攻（物理系）

必修・選択
Required / Selected

選択

授業の目的　【日本語】
Goals of the Course(JPN)

本授業の前半では、顕微鏡のデータ解析に必要な画像解析法と統計的手法の基礎を学び、そのためのプログラミング技術を習得する。後半は一分子計測によるとタンパク質の動態および機能の発展的内容を学習・習得するために、英語の教科書の輪講を行う。受講者が分担して、発表と説明、そして内容に関する議論を行う。教科書の内容の単なる紹介ではなく、最先端の研究の論文内容を適宜紹介しながら、修士論文のテーマに結び付く専門的知識の習得と研究指針の議論を各回2.5時間程度行う。また、英語での議論や発表の技術を習得するために、受講者の習熟度に合わせて適宜英語発表の指導を行う。

授業の目的　【英語】
Goals of the Course

In the first half of this class, the students learn the basics of image analysis method and statistical method necessary for data analysis of microscope, and learn programming technique for that. In the second half, we will hold lectures in English textbooks to learn and acquire the developmental contents of protein dynamics and functions according to single molecule measurement. The students will explain the contents and discuss about that. No only just introducing the content of textbooks, we will acquire expert knowledge leading to the theme of the master's thesis. Also, in order to acquire skills in discussion and presentation in English, the supervisor will give an advie on English presentation according to students' proficiency.

到達目標　【日本語】
Objectives of the Course(JPN))

一分子計測法で得られた画像の解析方法の原理を理解し、実際に様々な画像処理を行い、タンパク質の機能解析ができること。

到達目標　【英語】
Objectives of the Course

Students should be able to understand the principles of how to analyze images obtained by single molecule measurement methods and actually perform various image processing to analyze protein functions.

授業の内容や構成
Course Content / Plan

第１回：画像解析の基礎
第２回：プログラミングの基本
第３回：画像処理１：ノイズフィルター
第４回：画像処理２：バックグラウンド処理
第５回：画像処理３：トラッキング
第６回：統計処理の理論１
第７回：統計処理の実習
第８回：論文紹介１
第９回：モータータンパク質の一分子計測１：リニアモータータンパク質
第10回：モータータンパク質の一分子計測２：回転モータータンパク質
第11回：膜タンパク質の一分子計測１：イオンチャネル
第12回：膜タンパク質の一分子計測２：トランスポーター
第13回：DNA関連タンパク質１：トポイソメラーゼ・ジャイレース
第14回：DNA関連タンパク質１：ヘリカーゼ
第15回：論文紹介２

授業後に毎回宿題を課すので、次回時に小レポートとして提出する。

1: Basics of Image Analysis
2: Basics of Programming
3: Image processing 1: Noise filter
4: Image processing 2: Background processing
5: Image processing 3: Tracking
6: Theory of statistical analysis 1
7: Practice of statistical processing
8: Paper reading 1
9: Single moleculemeasurement of motor protein 1: Linear motor protein
10: Single molecule measurement of motor protein 2: Rotating motor protein
11: Single molecule measurement of membrane protein 1: Ion channel
12: Single molecule measurement of membrane protein 2: Transporter
13: DNA related protein 1: Topoisomerase gyrase
14: DNA related protein 1: helicase
15: Paper reading 2

Students should submit a small report for subjects indicated during each class.

履修条件
Course Prerequisites

生体分子動態機能研究室に配属されていること。