授業の目的 【日本語】
Goals of the Course(JPN) | | | この授業では、タンパク質に関する基礎知識を習得するとともに、物理的な考え方や実験手法、ならびに人工知能技術を用いて、タンパク質のアミノ酸配列、立体構造、物理化学的性質、機能などを理解するための基礎的な能力を養うことを目的とする。 |
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授業の目的 【英語】
Goals of the Course | | | This course is designed to equip basic knowledge about proteins and to clutivate basic skills necessary for understanding their amino acid sequences, three-dimensional structures, physicochemical properties and functions etc. using physical concepts, experimental methods, and artificial intelligence technology. |
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到達目標 【日本語】
Objectives of the Course(JPN)) | | この授業では、受講者が以下のことをできるようになることを目標とする。
１．タンパク質に関する基礎知識について理解し、説明できる。
２．タンパク質のアミノ酸配列、立体構造、物理化学的性質、機能について理解し、説明できる。
３．タンパク質の研究で用いられる物理的な考え方や実験手法、ならびに人工知能技術について理解し、説明できる。 |
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到達目標 【英語】
Objectives of the Course | | The achievement goals of this course for students are to:
1. Understand and explain basic knowledge about proteins.
2. Understand and explain the amino acid seqnences, three-dimensional structures, physicochemical properties and functions
3. Understand and explain the physical concepts, experimental methods, and artificial intelligence technology for studying proteins. |
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バックグラウンドとなる科目【日本語】
Prerequisite Subjects | | |
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バックグラウンドとなる科目【英語】
Prerequisite Subjects | | | Biological Science, Statistical Mechanics |
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授業の内容【日本語】
Course Content | | 本授業は以下の内容で構成されています。
（前半：千見寺）
１．タンパク質の基礎知識と立体構造予測
２．人工知能の基礎
３．深層学習を用いたタンパク質の立体構造予測
（後半：寺田）
４．タンパク質のアミノ酸配列、立体構造、物理化学的性質、機能
５．タンパク質の研究で用いられる物理的な考え方や実験手法 |
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授業の内容【英語】
Course Content | | This class covers the following topics:
[1st half: Chikenji]
1. Basic knowledge about proteins and protein structure prediction
2. Fundamentals of artificial intelligence
3. Deep learning–based protein structure prediction algorithms
[2nd half: Terada]
4. Amino acid seqnences, three-dimensional structures, physicochemical properties and functions of proteins
5. Physical concepts, experimental methods for studying proteins. |
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成績評価の方法と基準【日本語】
Course Evaluation Method and Criteria | | | 前半・後半ともに各回終了直後にTACTによる簡単な小テストを行い、全14回中11回以上の提出を成績評価の前提条件とする。前半の成績は期末試験（15%）とレポート（35%）により評価する。後半の成績は期末試験（35%）とレポート（15%）により評価する。達成目標の各項目についての基本的な概念を適切に説明することができて、かつ基本的な問題が解けることが合格の基準となる。 |
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成績評価の方法と基準【英語】
Course Evaluation Method and Criteria | | Assessment will be based on final exams and reports. Success is measured by the ability to explain the fundamental concepts behind each achievement goal and to solve basic problems.
Level of achievement of students’ objectives will be evaluated by a final exam (15%) and reports (35%) in the first half, and by a final exam (35%) and reports (15%) in the second half. Credits are given if the students can appropriately explain basic concepts and solve basic questions regarding each items in achevement goals with a score of 60 or higher out of 100. |
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履修条件・注意事項【日本語】
Course Prerequisites / Notes | | |
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履修条件・注意事項【英語】
Course Prerequisites / Notes | | | There is no specific requirement. |
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教科書【日本語】
Textbook | | （前半：千見寺）特に指定しない
（後半：寺田）有坂文雄、「タンパク質科学－生物物理学的なアプローチー」、裳華房(2021)、ISBN 978-4-7853-5244-8 |
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教科書【英語】
Textbook | | [1st half: Chikenji] Not specified.
[2nd half: Terada] Fumio Arisaka, "Protein Science - A Biophysical Approach", Shokabo (2021), ISBN 978-4-7853-5244-8 (in Japanese) |
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参考書【日本語】
Reference Book | | |
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参考書【英語】
Reference Book | | | Specified during the lecture. |
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授業時間外学習の指示【日本語】
Self-directed Learning Outside Course Hours | | （前半：千見寺）講義中に課題を提示する。
（後半：寺田）教科書の対応する部分を講義と並行して読み進めることが望ましい。また、数回のレポート課題を出すので、解いて提出すること。 |
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授業時間外学習の指示【英語】
Self-directed Learning Outside Course Hours | | [1st half: Chikenji] Assignments will be given during the lecture.
[2nd half: Terada] Students are recommended to read the corresponding part of the textbook. In addition, report assignments will be given a few times. |
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使用言語【英語】
Language used | | |
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使用言語【日本語】
Language used | | |
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授業開講形態等【日本語】
Lecture format, etc. | | | 授業は対面のみで行う（変更がある場合には、別途案内する）。 |
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授業開講形態等【英語】
Lecture format, etc. | | | Lectures are given on-site (Further changes may be announced, if any). |
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遠隔授業（オンデマンド型）で行う場合の追加措置【日本語】
Additional measures for remote class (on-demand class) | | |
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遠隔授業（オンデマンド型）で行う場合の追加措置【英語】
Additional measures for remote class (on-demand class) | | |
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実務経験のある教員等による授業科目（大学等における修学の支援に関する法律施行規則に基づくもの）＜実務経験について＞
Courses taught by Instructors with practical experience(Practical experience) | | |
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実務経験のある教員等による授業科目（大学等における修学の支援に関する法律施行規則に基づくもの）<実務経験と本授業との関連性>
Courses taught by Instructors with practical experience(Relevance of the practical experience to this course) | | |
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